La réserve marine d'Aqaba, établie en 1997 et agrandie en 2019, protège sept zones récifales distinctes allant de South Beach à la frontière saoudienne, chacune façonnée par des gradients de profondeur qui passent de lagons peu profonds à des tombants verticaux dépassant 400 mètres au large.
La plongée à Aqaba a acquis une reconnaissance internationale après le sabordage délibéré de navires militaires désarmés entre 1999 et 2019, créant des structures récifales artificielles qui accueillent désormais d'importantes populations de mérous, de barracudas et de requins de récif. Le Cedar Pride, un cargo libanais de 75 mètres sabordé en 1985, repose à 27 mètres et constitue l'épave la plus photographiée de la région, sa coque encroûtée de coraux mous et patrouillée par des bancs de poissons-verre. Le Tank, un véhicule antiaérien M42 Duster positionné à 6 mètres en 1999, fonctionne comme un site d'entraînement où les poissons-perroquets broutent les algues colonisant sa tourelle.
La visibilité dans la réserve atteint en moyenne 20 à 30 mètres pendant les heures matinales, lorsque le vent minimal et la circulation réduite des bateaux préservent la clarté de l'eau avant que les courants thermiques de l'après-midi ne soulèvent les sédiments près du littoral. Le système récifal de First Bay, accessible à 200 mètres de South Beach, présente des coraux en table à 5–12 mètres qui abritent des poissons-lions juvéniles et des murènes. Le récif de Power Station, situé à 8 kilomètres au sud, propose des plongées dérivantes le long d'un tombant descendant jusqu'à 60 mètres, où les plongeurs rencontrent des raies aigles et occasionnellement des requins-baleines entre mai et septembre.
La plongée sous-marine à Aqaba est pratiquée par 22 centres de plongée agréés, tous soumis aux réglementations de l'Autorité de la zone économique spéciale d'Aqaba qui imposent l'interdiction des plastiques à usage unique et des systèmes d'amarrage sans ancre. La réserve ne facture aucun droit d'entrée quotidien, bien que les opérateurs individuels facturent des plongées guidées entre 35 et 65 JOD selon la distance du site et l'inclusion de l'équipement. Les plongées de nuit aux Japanese Gardens révèlent des poulpes en chasse et des danseuses espagnoles, tandis que les plongeurs avancés ciblent l'épave du Taiyong à 28 mètres, un cargo de 45 mètres sabordé en 2019 dont les cales restent largement intactes.
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